Van 1 april 1986 tot 1 april 1999 was de heer Peeters lid van de maatschap KNO-heelkunde Noord-Limburg te Venlo en Venray. Gedurende deze periode heeft de heer Peeters diverse functies vervuld binnen en buiten de organisatie van de ziekenhuizen en de medische staf, zoals bestuurslid en penningmeester medische staf, voorzitter medische staf, voorzitter financiële commissie medische staf, voorzitter Stuurgroep Zorgvernieuwing, mede-oprichter en voorzitter KNO-Vereniging Limburg, lid Landelijke KNO visitatiecommissie niet opleidingsklinieken, bestuurslid Stichting Nascholing KNO-heelkunde, initiator/voorzitter commissie managementparticipatie en bestuurslid regio 26 van de Landelijke Specialisten Vereniging.

Van 1 april 1999 tot 1 april 2003 was de heer Peeters voorzitter Raad van Bestuur van de Stichting VieCuri Medisch Centrum voor Noord-Limburg (voorheen Stichting Ziekenhuizen Noord-Limburg). De Stichting Ziekenhuizen Noord-Limburg, in 1988 gevormd door een fusie van de ziekenhuizen te Venlo en Venray) maakte een alomvattend reorganisatieproces door, dat in twee fasen heeft geleid tot één patiëntgerichte ziekenhuisorganisatie voor de regio Noord-Limburg (de feitelijke fusie van de twee ziekenhuizen, sedert 16 september 2002 tot uitdrukking gebracht in de nieuwe naam en huisstijl, VieCuri, Medisch Centrum voor Noord-Limburg).

Sedert 1 april 2003 is de heer Peeters werkzaam als Voorzitter van de Raad van Bestuur van het academisch ziekenhuis Maastricht. Vanaf zijn benoeming heeft de heer Peeters zijn aandacht voornamelijk gericht op de strategische heroriëntatie van het azM naar de toekomst toe alsmede de ombuigingsoperatie die als gevolg van de noodzakelijk door te voeren bezuinigingen nodig is. Tevens wordt gewerkt aan een intensivering van de samenwerking tussen het azM en de Universiteit Maastricht (UM).