Voorbeelden hiervan zijn aandoeningen van de schildklier (hyperthyreoïdie = verhoogde werking van de schildklier), reuma, spierziekten, nierziekten, niertransplantatie, hartziekten en sommige aangeboren afwijkingen van de moeder. Ook bij sommige aangeboren afwijkingen van het kind (trisomie 13) is aangetoond dat ze een rol spelen in het ontstaan van zwangerschapsvergiftiging. Van deze afwijkingen is vaak nog niet in alle gevallen bekend hoe ze het ontstaan van zwangerschapsvergiftiging beïnvloeden en of je er wat tegen kunt doen. In andere gevallen is er juist wel weer enige ervaring aanwezig. Meestal kan de zwangerschap bij het bestaan van afwijkingen, het beste in een gespecialiseerd ziekenhuis, door een team van specialisten begeleid worden.

Bij specifieke ziekten of afwijkingen kan het verstandig zijn om voor de zwangerschap een gesprek met de huisarts of gynaecoloog te hebben om te bespreken of er risico's zijn en of er eventueel maatregelen getroffen kunnen worden die ervoor moeten zorgen dat de zwangerschap zo goed mogelijk verloopt.